Травматический пистолет Есаул-3 ПДТ-13Т калибра .45Rubber от предыдущей модели (ПДТ-9Т "Есаул") отличается используемым боеприпасом - .45 Rubber вместо 9 мм Р.А. Обозначение "Есаул-3" новая модель получила вслед за вторым образцом оружия самообороны на базе пистолета-пулемета Кедр - пистолетом "Есаул-2". Вторая модель не прошла стадию сертификации, так как являлась модификацией травматического пистолета ПДТ-9Т с возможностью автоматической стрельбы, что не совсем укладывалось в рамки оружейного законодательства.
"Есаул-3" полностью выполнен из стали. Автоматика работает по схеме со свободным затвором. Стрельба ведется с закрытого затвора, который полностью скрыт в ствольной коробке, а за его пределы выступает только рукоятка взведения затвора. Ударно-спусковой механизм - курковый, выполнен единым блоком, допускает ведение только одиночного огня.
С целью не допустить стрельбу твердым предметом, в ствол впрессовывается стальной лейнер с двумя давлеными выступами. Канал ствола - хромирован.
Питание боеприпасами осуществляется из отъемного коробчатого магазина емкостью 10 патронов. Прицельные приспособления - открытые, нерегулируемые.Предохранитель расположен на правой стороне ствольной коробки и имеет только две позиции: ОД - одиночный огонь и ПР - предохранитель. Кнопка выброса магазина находится на левой стороне приемника магазина.